10× Genomics单细胞转录组

10XGenomics提供的Chromium单细胞解决方案能够从多个角度捕获细胞活性的分子读数。该平台基于NextGEM技术，其核心之处在于能够产生成千上万个单细胞微滴，而每个微滴都含有一个可识别的条形码，便于下游分析。 10X Genomics Chromium系统采用先进的微流控技术，可在几分钟内完成单细胞微滴生成和条形码标记，后续可继续进行文库制备，与illumina平台无缝衔接。 10x Genomics单细胞转录组测序有效地解决了组织样本无法破解的细胞异质性难题，有助于发现新的细胞类型；并基于大量的单细胞基因表达数据，可以提供细胞表达特征聚类、亚群表达特征的分析、标志物筛选等方面的分析，是一种高效的单细胞基因表达水平检测技术。

案例分析

Decoding lymphomyeloid divergence and immune hyporesponsiveness in G-CSF-primed human bone marrow by single-cell RNA-seq 单细胞转录组测序解码G-CSF诱导的人骨髓淋巴细胞分化和免疫低反应性

发表期刊：Cell Discovery 影响因子：33.5 发表时间：2022年

研究背景

异基因造血干细胞移植（allogeneic hematopoietic stem cell transplantation，allo-HSCT）是目前血液系统恶性肿瘤的有效治疗手段，但移植后合并症移植物抗宿主疾病（Graft-versus-host disease，GVHD）是造成移植后患者死亡的主要原因之一。粒细胞集落刺激因子（granulocyte colony-stimulating factor, G-CSF ）是临床上广泛应用的造血干细胞动员剂, 可通过免疫调节作用降低急性GVHD的发生率，而不影响移植物抗白血病效应。此外，研究表明G-CSF动员的骨髓（G-BM）移植具有与G-CSF动员的外周血干细胞移植相当的植入效果和较低的GVHD风险，提示G-BM有独特的免疫调节特性。然而，迄今为止仍未精确解析G-CSF影响人骨髓造血分化及诱导免疫耐受的机制。

技术路线

部分结果

G-CSF动员前后人脑脊髓炎中T/NK谱系的亚聚类

研究结论

该研究分析了G-CSF动员前后人骨髓单细胞精度的转录组图谱，揭示了G-CSF刺激导致骨髓内造血分化淋髓偏倚的细胞层级，并深入解析了G-CSF通过直接和间接途径诱导T/NK细胞免疫低反应性的相关分子特征及潜在机制，为临床上治疗血液恶性肿瘤的HSCT策略优化及预防GVHD提供了重要线索。

参考文献

You G, Zhang M, Bian Z, et al. Decoding lymphomyeloid divergence and immune hyporesponsiveness in G-CSF-primed human bone marrow by single-cell RNA-seq[J]. Cell Discov. 2022, 8(1):59.