非标记定量蛋白质组学
期刊:International Journal of Biological Sciences 影响因子:9.2 发表时间:2022年 发表单位:上海中医药大学附属曙光医院
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是一种以脂肪堆积为特征的肝病,影响全球25%以上的人口,分子机制不明。脂质从头生成被认为是NAFLD发展的基本步骤,是由甘油三酯(TG)合成和降解之间的不平衡引起的,已有研究表明,转录因子(TF)、RNA结合蛋白和泛素连接酶可在其间发挥作用。
以高脂肪饲料喂养的NAFLD小鼠为研究对象,采用无标签定量蛋白质组学策略识别与NAFLD相关的肝脏差异表达蛋白,通过功能分析筛选关键转录因子,挖掘其调控NAFLD的相关生理机制。
图1 研究思路
图2 基于label-free的差异蛋白鉴定、GO/KEGG富集分析和IPA分析
图3 基于差异表达蛋白的功能信息分析显示与代谢功能障碍相关的TF
本研究通过定量蛋白质组学对NAFLD发展过程中涉及的蛋白质表达模式和生物过程扰动进行了全面分析,发现了三种新的NAFLD相关TF:Tcea1、Rbbp4和ILF2,并在NAFLD模型小鼠和临床肝脏样本中进行了验证。 后续功能分析表明,下调3个转录因子均可通过调节脂肪酸合成或β氧化相关基因的表达,显著促进AML12肝细胞脂质积累。相反,过表达Tcea1、Rbbp4和ILF2可改善肝细胞脂肪变性。 这些发现提出了新的脂质代谢相关TF,可能在预防NAFLD中发挥潜在作用。
Zhi S, Congcong Z, Zhiling G, et al. Quantitative proteomics of HFD-induced fatty liver uncovers novel transcription factors of lipid metabolism[J]. Int J Biol Sci, 2022.
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